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妹妹五月天
生物体的步履不单是是大脑看成的居品;相背,它们产生于大脑、肉体和环境之间的动态互相作用。为了揭示潜在的神经戒指机制,斥地一种整合数据初始的模拟系统是至关要紧的,该模拟受实验数据的功令和参数化,并集成了大脑、肉体和环境的详备模子。该模子将准确地捕捉正在盘考的生物系统的特征和能源学,从而考据表面和为生物实验作念出瞻望。
现在,一经有一些基于数据初始的模子,不错模拟大脑(举例小鼠低级视觉皮层、小鼠纹状体和大鼠体嗅觉皮层),也不错出奇模拟动物步履(举例用于果蝇和啮齿类动物的神经机械模子)。OpenWorm斥地了基于数据的神经系统和肉体模子,这是贪图生物学边界的一项草创性举措。关系词,这些模子的集成是开环的,这意味着它们衰败来自环境的反映。
因此,现在还莫得任何基于数据初始的模子大概十足孤高集成数据初始模子的通盘条目,而咱们艰巨需要这么的集成来鼓舞对神经戒指机制的富厚。
近日,北京智源东说念主工智能盘考院(BAAI)、北京大学黄铁军、马雷等东说念主在 Nature 子刊 Nature Computational Science 上发表了题为:An integrative data-driven model simulating C. elegans brain, body and environment interactions 的盘考论文,该论文还被选为当期的封面论文。
该盘考斥地了一个数据初始的生物智能模拟系统——BAAIWorm(天宝),初度杀青了秀丽隐杆线虫的大脑、肉体与环境的闭环仿真,为探索大脑与步履之间的神经机制提供要紧盘考平台。
生物体的步履受到其大脑、肉体和环境之间复杂的互相作用的影响。而现存的数据初始模子要么鄙吝大脑,要么鄙吝肉体-环境,衰败一个集成的数据初始模子。
一个集成的数据初始模子必须孤高以下几点特定需求:
第一,它应该包含一个生物物理学上详备的大脑模子,该模子具有与实在生物体不异的神经结构和神经看成模式;
第二,它应该包括一个试验的和高性能的肉体和环境模子,便于绵薄的步履量化;
第三,最关节的是,大脑模子不仅要戒指与编造环境交互的肉体模子,还要收受来自肉体和环境模子的反映,斥地闭环交互。
盘考团队以为,经典模式生物秀丽隐杆线虫(C. elegans)是斥地这种贯穿大脑、肉体和环境的整合数据初始模子的典范。秀丽隐杆线虫一经十足映射了通盘302个神经元的格式(在成体牝牡同体中),以及贯穿组和突触水平的结构,其单个神经看成和全脑神经能源学的记载亦然可得到的,其肉体大概很好地重建,唯有95个肌肉细胞,它还进展出容易量化的步履,举例爬行、游水和觅食。
因此,秀丽隐杆线虫绵薄的结构和丰富的数据为创建一个集成的数据初始模子提供了坚实的基础。
在这项最新盘选取,盘考团队提倡了一种整合数据初始的线虫模子——BAAIWorm(汉文名为天宝),该模子由大脑模子和肉体-环境模子这两个子模子构成。
最初,盘考团队斥地了一种线虫觅食神经回路的神经聚积模子(大脑模子)。它是基于具有生物物理细节的区室神经元模子构建的,神经元的分隔长度小于2微米,编码的神经看成与活体线虫不异。
其次,盘考团队斥地了线虫的肉体-环境模子,该肉体模子包含96块肌肉,大概以30帧每秒的及时速率进行模拟,并大概粗放量化步履。
第三,盘考团队斥地了大脑模子与肉体-环境模子之间的闭环交互,以模拟线虫以“之”字形轨迹向吸序言(attractor)移动。神经聚积模子中的嗅觉神经元由环境中吸序言的浓度激活,肉体模子中的肌肉由神经聚积模子中的畅通神经元戒指。
av天堂临了,盘考团队对神经聚积模子进行了东说念主工扰动,并提倡,神经突起或突触/流毒贯穿的缺失会骚扰全局神经动态,顽固精准的前进畅通。
总的来说妹妹五月天,该盘考提倡了一个由大脑模子和肉体-环境模子构成的基于数据初始的秀丽隐杆线虫整合模子——BAAIWorm(天宝),基于实验数据,采器具有实在格式学、贯穿组学和神经群体能源学特征的多区室模子构建大脑模子。同期,肉体-环境模子使用了传神的肉体和三维物理环境。通过两个子模子之间的闭环交互,BAAIWorm再现了在线虫中不雅察到的实在的趋向吸序言的“之”字形畅通模式。盘考团队还运用这个模子分析了神经系统结构对神经看成和步履的影响。该盘考提倡的BAAIWorm(天宝)不错增强咱们对大脑若何戒指肉体与周围环境互动的富厚。
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